C'est à Fenerbahce que Emre Asik a réelement éclaté après des debuts modestes au Balikesirspor.
Remercié par sa direction après avoir conquis le titre en 1996, il rejoignit un des autres clubs du Bosphore, Istanbulspor.
Son retour au plus haut niveau date de l'Euro 2000, pendant lequel il signa pour le club phare d'Istanbul, le Galatasaray, avec lequel il remporta la Coupe de l'UEFA et la Super Coupe d'Europe